MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis str. MC2 155 chromosome

Total Repeats: 166125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008596	CGA	3	9	503	511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118468117
2	NC_008596	GGCTG	2	10	513	522	0 %	20 %	60 %	20 %	118468117
3	NC_008596	CGT	2	6	540	545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118468117
4	NC_008596	CCA	2	6	602	607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118468117
5	NC_008596	CTG	2	6	628	633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118468117
6	NC_008596	CCG	2	6	716	721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118468117
7	NC_008596	GCT	2	6	744	749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118468117
8	NC_008596	GC	4	8	830	837	0 %	0 %	50 %	50 %	118468117
9	NC_008596	CTGC	2	8	877	884	0 %	25 %	25 %	50 %	118468117
10	NC_008596	GAG	2	6	892	897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118468117
11	NC_008596	GGTGGC	2	12	942	953	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	118468117
12	NC_008596	CGA	2	6	963	968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118468117
13	NC_008596	GTG	2	6	1018	1023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118468117
14	NC_008596	CGC	2	6	1026	1031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118468117
15	NC_008596	GACC	2	8	1032	1039	25 %	0 %	25 %	50 %	118468117
16	NC_008596	CAC	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118468117
17	NC_008596	GCC	2	6	1132	1137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118468117
18	NC_008596	ACGG	2	8	1147	1154	25 %	0 %	50 %	25 %	118468117
19	NC_008596	GTCG	2	8	1188	1195	0 %	25 %	50 %	25 %	118468117
20	NC_008596	GCA	2	6	1235	1240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118468117
21	NC_008596	GCT	2	6	1281	1286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118468117
22	NC_008596	CCG	2	6	1289	1294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118468117
23	NC_008596	CGA	2	6	1398	1403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118468117
24	NC_008596	CGA	2	6	1428	1433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118468117
25	NC_008596	CAC	2	6	1560	1565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118468117
26	NC_008596	CGGC	2	8	1588	1595	0 %	0 %	50 %	50 %	118468117
27	NC_008596	GAT	2	6	1603	1608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118468117
28	NC_008596	GGT	2	6	1618	1623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118468117
29	NC_008596	GCC	2	6	1639	1644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118468117
30	NC_008596	CTG	2	6	1663	1668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118468117
31	NC_008596	GAG	2	6	1844	1849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118471954
32	NC_008596	CGTGT	2	10	1874	1883	0 %	40 %	40 %	20 %	118471954
33	NC_008596	CGG	2	6	1969	1974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118471954
34	NC_008596	CGCA	2	8	2001	2008	25 %	0 %	25 %	50 %	118471954
35	NC_008596	TTG	2	6	2012	2017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118471954
36	NC_008596	GT	3	6	2049	2054	0 %	50 %	50 %	0 %	118471954
37	NC_008596	CGG	2	6	2056	2061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118471954
38	NC_008596	CGG	2	6	2098	2103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118471954
39	NC_008596	GAC	3	9	2108	2116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118471954
40	NC_008596	CCG	2	6	2153	2158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118471954
41	NC_008596	GGTG	2	8	2194	2201	0 %	25 %	75 %	0 %	118471954
42	NC_008596	CTG	2	6	2276	2281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118471954
43	NC_008596	TCA	2	6	2295	2300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118471954
44	NC_008596	GTG	2	6	2342	2347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118471954
45	NC_008596	GAG	2	6	2453	2458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118471954
46	NC_008596	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118471954
47	NC_008596	TCGATC	2	12	2673	2684	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118467917
48	NC_008596	TTG	2	6	2739	2744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118467917
49	NC_008596	CGC	2	6	2796	2801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118467917
50	NC_008596	CG	3	6	2822	2827	0 %	0 %	50 %	50 %	118467917
51	NC_008596	TCG	2	6	2841	2846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118467917
52	NC_008596	CAA	2	6	2899	2904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118467917
53	NC_008596	TGC	2	6	2955	2960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118467917
54	NC_008596	GC	3	6	2959	2964	0 %	0 %	50 %	50 %	118467917
55	NC_008596	GTT	2	6	2968	2973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118467917
56	NC_008596	TC	3	6	2986	2991	0 %	50 %	0 %	50 %	118467917
57	NC_008596	CGA	2	6	3031	3036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118467917
58	NC_008596	GC	3	6	3073	3078	0 %	0 %	50 %	50 %	118467917
59	NC_008596	GGT	2	6	3091	3096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118467917
60	NC_008596	CGC	2	6	3193	3198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118467917
61	NC_008596	CGGCG	2	10	3202	3211	0 %	0 %	60 %	40 %	118467917
62	NC_008596	CG	3	6	3222	3227	0 %	0 %	50 %	50 %	118467917
63	NC_008596	TCG	2	6	3234	3239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118467917
64	NC_008596	GCA	2	6	3315	3320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118467917
65	NC_008596	GC	3	6	3395	3400	0 %	0 %	50 %	50 %	118467917
66	NC_008596	GTG	2	6	3423	3428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118467917
67	NC_008596	TG	3	6	3427	3432	0 %	50 %	50 %	0 %	118467917
68	NC_008596	TCG	2	6	3435	3440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118467917
69	NC_008596	CGA	2	6	3451	3456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118467917
70	NC_008596	GCCA	2	8	3497	3504	25 %	0 %	25 %	50 %	118467917
71	NC_008596	TGT	2	6	3555	3560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118467917
72	NC_008596	TGC	2	6	3582	3587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118467917
73	NC_008596	CGA	2	6	3592	3597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118467917
74	NC_008596	GGC	2	6	3624	3629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118467917
75	NC_008596	GC	4	8	3628	3635	0 %	0 %	50 %	50 %	118467917
76	NC_008596	GGA	2	6	3700	3705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118467917
77	NC_008596	CG	3	6	3712	3717	0 %	0 %	50 %	50 %	118467917
78	NC_008596	GAC	2	6	3743	3748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118467917
79	NC_008596	TGG	2	6	3765	3770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118467917
80	NC_008596	CGA	3	9	3789	3797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118470893
81	NC_008596	GAG	2	6	3805	3810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118470893
82	NC_008596	ATC	2	6	3836	3841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118470893
83	NC_008596	GAG	2	6	3883	3888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118470893
84	NC_008596	CGCGG	2	10	3892	3901	0 %	0 %	60 %	40 %	118470893
85	NC_008596	CGGCCG	2	12	3924	3935	0 %	0 %	50 %	50 %	118470893
86	NC_008596	CGGCC	2	10	3939	3948	0 %	0 %	40 %	60 %	118470893
87	NC_008596	ACT	2	6	4017	4022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118470893
88	NC_008596	GGT	2	6	4107	4112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118470893
89	NC_008596	CTG	2	6	4225	4230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118470893
90	NC_008596	CGC	2	6	4239	4244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118470893
91	NC_008596	GGT	2	6	4245	4250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118470893
92	NC_008596	GTG	2	6	4261	4266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118470893
93	NC_008596	TCG	2	6	4280	4285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118470893
94	NC_008596	CGT	2	6	4298	4303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118470893
95	NC_008596	AGA	2	6	4601	4606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118470567
96	NC_008596	CAC	2	6	4717	4722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118470567
97	NC_008596	CGA	2	6	4752	4757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118470567
98	NC_008596	CG	3	6	4778	4783	0 %	0 %	50 %	50 %	118470567
99	NC_008596	CGA	2	6	4824	4829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118470567
100	NC_008596	CCA	2	6	4871	4876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118470567
101	NC_008596	GTC	2	6	4882	4887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118470567
102	NC_008596	GGT	2	6	4942	4947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118470567
103	NC_008596	TAC	2	6	5035	5040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118470567
104	NC_008596	CAC	2	6	5094	5099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118470567
105	NC_008596	CGAC	2	8	5135	5142	25 %	0 %	25 %	50 %	118470567
106	NC_008596	CG	3	6	5160	5165	0 %	0 %	50 %	50 %	118470567
107	NC_008596	CAA	2	6	5190	5195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118470567
108	NC_008596	CGA	2	6	5217	5222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118470567
109	NC_008596	GGT	2	6	5241	5246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118470567
110	NC_008596	CGA	2	6	5247	5252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118470567
111	NC_008596	CGT	2	6	5253	5258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118470567
112	NC_008596	CCG	2	6	5267	5272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118470567
113	NC_008596	CGA	2	6	5289	5294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118470567
114	NC_008596	GCC	2	6	5299	5304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118470567
115	NC_008596	TGGTC	2	10	5355	5364	0 %	40 %	40 %	20 %	118470567
116	NC_008596	CAG	2	6	5404	5409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118470567
117	NC_008596	CAT	2	6	5412	5417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118470567
118	NC_008596	GGT	2	6	5527	5532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118470567
119	NC_008596	GAG	2	6	5539	5544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118470567
120	NC_008596	GCG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118470567
121	NC_008596	GTG	2	6	5569	5574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118470567
122	NC_008596	AAG	2	6	5593	5598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118470567
123	NC_008596	CAAGGA	2	12	5604	5615	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118470567
124	NC_008596	TGA	2	6	5631	5636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118470567
125	NC_008596	GGC	2	6	5652	5657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118470567
126	NC_008596	AGACCA	2	12	5699	5710	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	118470567
127	NC_008596	TCGT	2	8	5734	5741	0 %	50 %	25 %	25 %	118470567
128	NC_008596	AGA	2	6	5744	5749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118470567
129	NC_008596	AGC	2	6	5759	5764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118470567
130	NC_008596	GCA	2	6	5766	5771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118470567
131	NC_008596	CTG	2	6	5789	5794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118470567
132	NC_008596	CAA	2	6	5811	5816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118470567
133	NC_008596	TCG	2	6	5824	5829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118470567
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255	NC_008596	CTCGAC	2	12	10600	10611	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	118470556
256	NC_008596	GTG	2	6	10612	10617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118470556
257	NC_008596	GCG	2	6	10648	10653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118470556
258	NC_008596	CCCGG	2	10	10658	10667	0 %	0 %	40 %	60 %	118470556
259	NC_008596	CACG	2	8	10687	10694	25 %	0 %	25 %	50 %	118470556
260	NC_008596	CG	3	6	10767	10772	0 %	0 %	50 %	50 %	118470556
261	NC_008596	CTG	2	6	10965	10970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118470556
262	NC_008596	CG	4	8	10994	11001	0 %	0 %	50 %	50 %	118470556
263	NC_008596	GAAC	2	8	11034	11041	50 %	0 %	25 %	25 %	118470556
264	NC_008596	TGG	2	6	11102	11107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118470556
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384	NC_008596	CAACGC	2	12	16962	16973	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	118472346
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